El `Toyota Yaris Verso 1999-2006` deriva del primer Yaris, pero añade una carrocería alta de mini monovolumen usada a menudo en ciudad, trayectos cortos o reparto ligero. Sus motores principales son los gasolina `1.3 2NZ-FE` y `1.5 1NZ-FE`, ambos con cadena de distribución, y el diésel `1.4 D-4D 1ND-TV`. En el mantenimiento del Toyota Yaris Verso conviene priorizar aceite, nivel, refrigeración, bujías, bobinas, correa auxiliar, caja automática de cuatro marchas y suspensión.
Por edad, importan más los periféricos que las averías grandes: latiguillos o tubos de freno traseros con campaña Toyota en algunas unidades `2000-2002`, óxido bajo, escape, frenos traseros, amortiguadores y rodamientos. En el `1ND-TV` hay que vigilar inyectores, EGR, turbo, nivel de aceite y ruido de cadena con muchos kilómetros; los gasolina exigen ralentí estable, poco consumo de aceite y refrigeración limpia.